По сравнению с другими регионами, расположенными на той же широте, на Токто наблюдается более умеренный климат. Частые туманы и высокая влажность способствуют тому, что флора архипелага напоминает субтропическую. Токто состоит из вулканических пород, что не благоприятствует произрастанию растений. Резкий наклон почвы на островах приводит к тому, что дождевая вода не накапливается, из-за чего почва является довольной сухой. Неблагоприятным условием для распространения растительности являются также высокая засоленность почвы и нехватка пресной воды. Следовательно, большинство растений на Токто являются травянистыми; низкими с коротким корнем. (Для травянистых растений характерны нежные стебли, хлорофилл в корковых клетках и короткая продолжительность жизни в 1–2 года.) Тем не менее, на Токто обнаружены порядка 50–60 видов растений.

 

В числе древесных растений, произрастающих на Токто, вид жимолости сомгвебуль-наму, бересклет японский, лох крупнолистный, коккулюс трехдольный, виноградовник короткоцветоножковый, камелия и т.д. Сомгвебуль-наму является особенно редким видом, который произрастает только на островах Уллындо и Токто. Этот кустарник достигает 1,5–2 метров в высоту и 20 см в диаметре. Растения на Токто обычно невысокие, что позволяет им выдержать сильный ветер с моря, а толстые и ворсистые листья помогают им хорошо переносить засуху и холод.

 

До сих пор проводились почти 30 исследований флоры Токто. Количество обнаруженных видов растений разнится от 34 до 75 в зависимости от исследователя.

Наземных животных, обнаруженных на Токто, можно разделить на птиц, насекомых и млекопитающих. Пока нет данных об обнаружении амфибий и рептилий.

 

В числе птиц, обитающих на архипелаге, чернохвостые чайки, малые качурки, тундровые лебеди, каменушки, вьюрки, желтогорлые овсянки, белые трясогузки, желтоголовые корольки, обыкновенные пустельги, пестролицые буревестники, перепела и т.д. Среди них самая большая численность популяции приходится на чернохвостых чаек, затем – малые качурки и пестролицые буревестники. Восемь видов, в том числе, соколы, осоеды, черные коршуны, хохлатые старики, серые неясыти, скопы, тундровые лебеди и черные журавли, находятся на грани вымирания. Пестролицые буревестники, малые качурки и чернохвостые чайки, которых можно увидеть только в Северо-Восточной Азии, обитают в сообществе. Численность популяции пестролицых буревестников и малых качурок уменьшается; предположительная численность чернохвостых чаек составляет 2–3 тыс. Южный наклон острова Содо и западная часть скалы Тонниммун-бави на острове Тондо, а также места, где произрастает житняк (род многолетних травянистых растений семейства злаковых), являются основными местами гнездования чернохвостых чаек.

 

Архипелаг Токто служит местом остановки перелетных птиц. В связи с этим 16 ноября 1982 года Токто был объявлен местом разведения морских птиц, а после того, как он был занесен в Список национального природного наследия под №336 в декабре 1999 года, Токто стал «Зоной защиты природного достояния».

На островах насчитываются 53 вида 35 семейств 9 родов насекомых. Так, на Токто обитают стрекозы, уховёртки, кузнечики, цикады, жуки, мухи, бабочки и т.д. Следует отметить, что при проведении исследований периодически появляются небольшие различия в перечне насекомых, обитающих на острове. Муссон и течение, свойственные острову, отразились и на насекомых, обитающих здесь. Так, 50,9% насекомых, обитающих на Токто относятся к южному региону Земли, а 39,7% – к северному. Насекомые южных регионов появились на островах под воздействием теплого течения Куросио и его ответвления - Цусимского течения. Около 90% насекомых, насчитывающихся на Токто, обитают также непосредственно на Корейском полуострове. 70% насекомых также являются идентичными с насекомыми острова Уллындо. Только 3% насекомых, обитающих на Токто, являются исключительно местными. На этом основании можно предположить, что насекомые Токто, как и его растения, распространялись на архипелаг с материка через остров Уллындо. Следует также отметить, что на Токто были обнаружены некоторые виды насекомых, которые не обитают на Корейском полуострове: клопы-слепняки островов Токто, жук-щелкун, вид божьей коровки ори-муданболлэ, бабочка Naratura bazalus Hewitson и т.д.

На Токто нет диких млекопитающих животных. Там живет только одна собака корейской породы сапсари, которую держат полицейские. В прошлом на рифах вокруг архипелага обитали японские морские львы, однако во время японского колониального ига из-за чрезмерного промысла этого вида животного в целях получения шкуры и жира, они практически исчезли. В 1973 году охранники Токто привезли с материка на острова10 кроликов, но через некоторое время их растущая численность начала угрожать экологии архипелага, в связи с чем их решили не разводить. Учитывая природные особенности островов, при ввозе неместных видов животных и растений нужно проявлять осторожность.

В последнее время в связи с обострением территориальных споров вокруг Токто происходит переоценка особенностей морской экосистемы архипелага и морских ресурсов его прибрежных вод. Исследования морской экологии и ресурсов вокруг Токто проводились и раньше, особенно в отношении морских живых организмов, но настоящее изучение экологии началось лишь в 1997 году. Группа специалистов по изучению Токто ежегодно осуществляет подводные исследования и собирает базовые экологические данные.

 

Архипелаг Токто, как и остров Уллындо, находится под влиянием теплого Цусимского течения, втекающего с юга, в силу чего вокруг Токто наблюдается большое количество тепловодных живых организмов. В зимний период температура воды в море может опускаться ниже +10°С, благодаря чему здесь обитают и холодноводные живые организмы. Это подтверждает особенности морского пространства, где пересекаются теплое и холодное течения. Токто имеет весьма важное значение с экологической точки зрения, так как у него уникальные природные особенности, отличающиеся от восточного и южного побережья, а также острова Чечжудо. В исследовании морской экологии, проводившемся с 1997 года, специалисты отобрали пять главных подводных пунктов в зависимости от типа рельефа, и проанализировали отдельные виды морских водорослей, беспозвоночных животных и рыб, обитающих в морских водах вокруг Токто, а также распространенность, численность и структуру их популяции.
По результатам исследования стало известно, что такие показатели разнятся в зависимости от конкретного места проведения исследования, глубины моря, географических особенностей и времени года.

До сегодняшнего дня зарегистрированы в общей сложности около 160 видов морских водорослей, в том числе, такие виды больших бурых водорослей как фукус, эклония кава, ундария перистая и т.д. Из беспозвоночных животных на Токто обитают как холодноводные, так и тепловодные виды, в том числе 32 вида многощетинковых червей, 6 видов неполнохвостых и 64 вида мягкотельных. Однако конкретные цифры немного меняются каждый раз, когда проводится соответствующее исследование.
Что касается рыб, то в 1997 году в прибрежных водах Токто были зарегистрированы 58 видов, но потом были обнаружены еще 19 видов, и на сегодняшний день в морских водах вокруг архипелага насчитываются 77 видов рыб. 37,8% составляют тропические рыбы, 22% – субтропические, а остальные 40,2% – рыбы умеренного пояса. По сравнению с морскими водами на южном побережье острова Чечжудо, вокруг Токто обитают больше видов рыб умеренного пояса, причиной чего является пересечение теплого и холодного течений вблизи архипелага.