また２００１年に両国首脳の合意を受けて大統領令で設けられた韓日・日韓歴史共同研究委員会の韓国側の委員長は、今度のことについて非難の声明を発表しました。声明は、「東京都教育委員会が、扶桑社発行のわい曲教科書を採択することにしたことは、２００１年に両国首脳の合意にもとづいて両国の専門家が行っている学術研究に支障をきたすことになる」として批判しました。そのうえで声明は、「東京教育委員会は、わい曲教科書の採択をただちに見直し、今後二度とこうした結果が出ないよう努力すべきだ」と強調しました。