これに対して、国家情報院は、３日、記者会見を行い、「神父１１５人の宣言は、事実無根だ」として強く否定しました。国家情報院の関係者は、「国家情報院の前身の安全企画部が、事件をねつ造したとするカトリック神父１１５人の主張は、事実ではない」として、当時の捜査に一点の偽りもないと改めて主張し、裁判記録の公開要求については、裁判所が決める問題で、国家情報院の捜査記録の公開に関しては、「判断し難い」と即答を避けました。