Từ 6 giờ sáng tới 6 giờ tối ngày 9/3, cử tri Hàn Quốc tiến hành bỏ phiếu bầu Tổng thống thứ 20 đồng loạt tại 14.464 điểm bỏ phiếu trên toàn quốc. Các cử tri thuộc diện bị cách ly hoặc mắc COVID-19 có thể bỏ phiếu từ 6 giờ tối tới 7 giờ 30 phút tối cùng ngày. 

Tổng số cử tri trong cuộc bầu cử lần này là 44.197.692 người. Trong đó, 16.323.602 cử tri đã tham gia bỏ phiếu sớm trong hai ngày 4-5/3, với tỷ lệ bỏ phiếu sớm đạt cao kỷ lục 36,93%. Giờ đây, dư luận quan tâm tỷ lệ bỏ phiếu cuối cùng có lần đầu vượt mốc 80% kể từ sau cuộc bầu cử Tổng thống thứ 15 vào năm 1997 hay không.

Trước đó, trong đợt bỏ phiếu sớm đã xảy ra một số vấn đề tranh cãi như thời gian bỏ phiếu dành cho cử tri mắc COVID-19 và cử tri thông thường bị trùng nhau, địa điểm bỏ phiếu không phân tách hướng đi cho các cử tri, thời gian chờ đợi của các cử tri nhiễm COVID-19 quá lâu. Tuy nhiên, trong ngày bỏ phiếu chính thức, thời gian bỏ phiếu của các cử tri thông thường và cử tri cách ly, mắc COVID-19 được phân chia rõ ràng. Ngoài ra, các cử tri cách ly hoặc nhiễm COVID-19 sẽ trực tiếp bỏ lá phiếu đã điền vào hòm phiếu tương tự như các cử tri khác.

Chủ tịch Ủy ban quản lý bầu cử trung ương Noh Jeong-hee trong tuyên bố toàn dân ngày 8/3 một lần nữa xin lỗi cử tri về những bất tiện và tranh cãi trong đợt bỏ phiếu sớm, cam kết sẽ quản lý công tác bỏ phiếu và kiểm phiếu một cách chính xác và minh bạch, kêu gọi cử tri tham gia bỏ phiếu vì một tương lai tốt đẹp hơn.

Trong ngày bầu cử chính thức, cử tri chỉ được phép bỏ phiếu tại điểm bỏ phiếu thuộc nơi cư trú. Khi đi bỏ phiếu, cử tri phải mang theo giấy tờ tùy thân như chứng minh thư, bằng lái xe, hộ chiếu, và phải đeo khẩu trang.

Kết quả kiểm phiếu sẽ được công bố theo từng khu vực bỏ phiếu. Toàn bộ quá trình bỏ phiếu, kiểm phiếu sẽ được truyền hình trực tiếp trên kênh Bầu cử Hàn Quốc (ETV) của Quốc hội.

Khi quá trình bỏ phiếu kết thúc, các hòm phiếu sẽ được niêm phong, và được quan chức quản lý bầu cử cùng giám sát viên chuyển tới 251 điểm kiểm phiếu dưới sự hộ tống của Cảnh sát.

Các cuộc bầu cử Tổng thống Hàn Quốc trước đây thường kết thúc kiểm phiếu vào khoảng 6-7 giờ sáng ngày hôm sau. Tuy nhiên, cuộc bầu cử lần này bố trí thời gian bỏ phiếu riêng cho các cử tri mắc COVID-19 nên thời gian bỏ phiếu kéo dài, dự kiến thời gian kiểm phiếu sẽ kết thúc muộn hơn.

Sau khi thời gian bỏ phiếu kết thúc, ba đài truyền hình mặt đất trong đó có Đài Phát thanh và truyền hình Hàn Quốc (KBS) sẽ tiến hành và công bố kết quả thăm dò ý kiến cử tri tại địa điểm bỏ phiếu.